一、進口貨物報關手續
在德國口岸進口結關的貨物，應由貨物承運人，貨主或收貨人向海關填送報單及海關特種申報單。海運貨物的報單應于貨物向海關呈驗后45天內填報，其它運輸方式則限于15天內填報。貨物可以按供國內消費或受海關監管的特別制度結關，否則應運出國外或予銷毀。郵運物品，無需由海關立即辦理結關續者，可以送呈一份特別呈驗貨物清單，按國際貨運的規定，可以送呈一份特別呈驗貨物清單，按國際貨運的規定，可以用郵包括運人的申報單，代替上述清單。
貨物如在限期內既未結關變未出口，應由海關接管直至向海關申報，在此期間一切費用和風險均由利害各方承擔在結關前進口商有權查詢貨物。德國海關要求報單使用聯合國經濟委員會的報單格式，申報人可以用打字機一次打出海關報單、裝船通知、提單、原產地證明、保險單等。納稅人繳納關稅后，對進口商來說已履行了納稅義務，可提取貨物結關。
二、保稅轉運貨物的報關手續
進口貨物可以申請按國內轉運制結關，這種轉運制作準許貨物免納關稅和捐稅，從進口地運往設于德國其它地方的海關辦事處。進口商應負責在指定日期內，將貨物原封不動地送交上述海關辦事處同并須提代保證。但是如應稅貨物能立即結關供國內消費，而且接轉運制結關對進口商并無經濟上的好處，或者如該項貨物以后將按共同體轉運制運經另一成員國境內，海關將拒絕該項貨物按國內轉運德國海關準許批量貨物憑陸運暫準進口貨物的報關手續運往德國，或德國運往另一上述公約的簽字國。海關將在進口地點即進入共同體或按本制度結關的地點和到達地兩處對貨物進行檢查。如需繳納保證金則轉運證已為貨物在共同體內進行的全部運轉提供一次運輸所需的全面擔保。
三、貨物存入海關保稅倉庫的報關手續
海關倉庫是海關對進口貨物放寬實施保護政策的一種措施。海關倉庫允許進口貨物免納關稅和捐稅，存入特許設立的倉庫，存入倉庫的貨物保許進行通常的整理（如改換包裝，整理揀選）在個別情況下，如經濟上所需要，可以準許進行再加工，存庫期一般不得超過5年。海關倉庫是一種對公眾開放的保稅倉庫，用于儲存復出口貨物或在進口時去路未定的貨物，又稱加鎖關口儲存待領倉庫。這種倉庫通常由私人團體或行號經營，在需要時，例如當自由貿易區和公共保總稱集團均已飽和時，海關可以特許增設私營保稅倉庫。海關延期納稅倉庫用于儲存最終將進入德國境的貨物。這些貨雖已結關，但關稅及捐稅尚未完納，進口商可以隨意提取庫存貨物，不受海關干預。因為每月提貨物的稅款均得憑帳冊延期至下月1日，甚至能延至15日完納。存儲期間如海關稅率發生改變，進口商可以申請按存貨物結關內銷時生效的新稅率完稅。某些農產品稅率經常作季節性的改變，其應納稅只能按出時適用的稅率計征。
四、自由貿易區
自由貿易區是海關放寬其保護政策的又一形式。德國在不來梅、漢堡、克期哈芬、不來梅哈芬、埃姆敦及基樂等港均有自由貿易區。在起運時如最終去向不明，或無法立即運出的成批貨物可長期寄存于自由區內， 無需在完任何關稅和捐稅。這種貨物可自由地在區內存儲轉運或復出口。德國國產貨運入區內后就成為出口貨，可享受相應的退稅待遇，自由區所存貨物在風區銷時須繳納關稅。除了克期哈芬只能存儲貨物外，所有以上自由區內都可進行裝卸、運輸、存儲取樣、分揀等等，所存貨物可以出售和拍賣，但不許向個另私人零售。在區內準許進行的工業活動只限于私人零售。在區內準許進行的工業活動只限于造船、修理和經德國聯幫財政部的特準的用進口原料進行加工的項目。漢堡自由區管理局有權批準進行工業生產、裝配及其他加工業務，所用原料可從國外進口。對于進口供國內消費的應稅物品或免稅品，均須辦理報關手續，海關的監管是為了保證貨物照章納稅完成應辦的放行手續德國目前實行的完稅后納制，貨物主行只是完成報關手續的一部分，關稅的計證則將視進口商的需要和報導提供的信貸保證延期30天或更長的時間繳納。
另外德國海關征收的間接稅有以下二種
1、進口平衡稅
進口貨物所征的這種稅，稅率與德國同樣貨物應納的增值稅相等；
2、消費稅
應征消費稅的品目為糖、啤酒、香精、咖啡、火柴、燈泡、用于廣告的螢光燈、撲克牌、煙、石油及其制品、醋酸、香檳酒。
